A Geneforge 2 főhőse a Shaper-rend tagja, akik erőteljes varázslók, és főprofiljuk az idézés, a mágiából élet alkotása. Hasonlóan az első részhez, a történetvezetés gyorsan nyílttá, szabaddá válik, teljesen a játékosra van bízva, hogyan akar haladni.