A Baltron a távoli jövőben játszódik, amikor a Bismark Birodalom támadást indít a föld ellen. Ehhez először a Star Lenion bolygót foglalják el, ahol új szuperfegyverük, a Baltron felépítését tervezik. A főhős feladata, hogy behatoljon a bolygóra és elpusztítsa a bázist.